Многоцветный вариант FISH-анализа в настоящее времянеобходим для точного описания сложных хромосомных перестроек. Чаще всего используются следующие варианты исследования:
24-цветная флюоресцентная гибридизация (multiplex-FISH). Данное исследование позволит с большей точностью выявить хромосомы, вовлеченные в перестройки, описать случаи со сложными кариотипами (более одной хромосомной аномалии ), определить маркерные хромосомы. Полученная информация крайне необходима как для первичного диагноза заболевания, так и для дальнейшего мониторинга. Кроме того, выявленная при диагнозе хромосомная аномалия может послужить маркером для определения клеток реципиента после трансплантации костного мозга.
FISH с применением пробы многоцветного бэндинга (MCB) для каждой пары хромосом. Метод позволяет с высокой точностью определить точки разрыва перестроенных хромосом, внутрихромосомные аномалии (делеции, инверсии, инсерции) и определить гены-кандидаты, участвующие в аномалии.