Мутации в FLT3 гене часто встречаются при остром миелобластном лейкозе (ОМЛ).  Бластные клетки с этими мутациями характеризуются агрессивным фенотипом, наличие мутаций в FLT3 гене ассоциировано с повышенной частой рецидивов. Определение мутационного статуса гена FLT3 при ОМЛ имеет прогностическое значение и помогает выделить группы пациентов для дальнейшей терапии.